Почти десятилетие после возвращения знаменитого космического корабля Федерация погружается в кризис. Исчезновение главных поставщиков кристаллов ставит под угрозу стабильность. Мистические события, ведущие к изоляции нескольких планет путём искривления пространства и времени, несут в себе следы чьей-то умышленной деятельности. Адмирал Павел Чехов, возглавляющий разведку Звездного Флота, назначает командира Тувока руководить новым экипажем, собранным из социальных изгнанников и даже преступников. Их задача — разгадать тайну пространственно-временных аномалий и предотвратить глобальную катастрофу, несмотря на риски и личные разногласия.